تندرج الأمانة العامة المساعدة للشؤون البرلمانية تحت مظلة الأمين العام للمجلس بإشراف الدكتور أحمد عبدالله ناصر الأمين العام المساعد للشؤون البرلمانية، حيث تعمل على تسهيل عمل المجلس فيما يتعلق بجلسات المجلس و لجانه الدائمة و المؤقتة و تيسير إجراءات السادة الأعضاء.
و يتبع الأمانة العامة المساعدة للشؤون البرلمانية كل من إدارة شؤون الجلسات المختصة بإعداد جداول أعمال المجلس، و مضابط الجلسات و التقارير السنوية للمجلس و إعداد الفهارس الشاملة، بالإضافة إلى إدارة شؤون اللجان و البحوث المختصة بتنفيذ قرارات اللجان و توصياتها و إعداد التقارير. و تعمل الأمانة العامة المساعدة للشؤون البرلمانية على تنسيق اجتماعات جميع اللجان الدائمة و المشتركه و المؤقتة. و من خلالها يتم التنسيق مع كلتا الإدارتين لإنجاز كل ما يتعلق بشؤون الجلسات و اللجان لعرضها نهائياً على سعادة الأمين العام للمجلس لاتخاذ القرارات المناسبة المتفقة مع سياسة المجلس.